193 papers
PHARMWATCH is een meervoudig beveiligd farmacogenomisch systeem dat de nauwkeurigheid van 'star allele'-interpretaties verbetert door gerelateerde varianten te screenen en de functionele integriteit te valideren, waardoor veiligere en betrouwbaardere doseringsaanbevelingen mogelijk worden.
Deze studie, uitgevoerd op data van het All of Us-programma, identificeert vijf genen met geslachts-specifieke effecten op cholesterol- en triglyceridenspiegels, wat de noodzaak onderstreept om geslacht te betrekken bij het beoordelen van cardiovasculaire risico's.
Deze Mendeliaanse randomisatiestudie toont aan dat er een genetisch causale relatie bestaat waarbij psoriasis het risico op inflammatoire darmziekten verhoogt, terwijl type 2-diabetes een omgekeerde associatie vertoont met colitis ulcerosa.
Dit onderzoek toont aan dat de slechte overeenkomst tussen verschillende polygenische scores voor type 2-diabetes volledig wordt verklaard door statistische onzekerheid, en benadrukt dat het opnemen van onzekerheidsmaten de betrouwbaarheid en klinische bruikbaarheid van deze voorspellingen aanzienlijk verbetert.
Een studie met de Penn Medicine Biobank toont aan dat het op grote schaal implementeren van genomische risicobeoordeling (GIRA) aanzienlijke verstoringen in het zorgstelsel kan veroorzaken door een groot aantal patiënten als hoog-risico te classificeren, terwijl de voorspellende waarde voor toekomstige ziektegevallen beperkt is en aanzienlijke verschillen bestaan tussen etnische groepen.
Deze studie identificeert een novel SLC30A9-deletie die via transcriptie-ontsnapping en translatieherstarting leidt tot oncogene eiwitten en zo een nieuwe genetische oorzaak voor familiaal medullair schildkliercarcinoom blootlegt buiten de bekende RET-mutaties.
Dit onderzoek biedt bewijs dat seksuele antagonisme en antagonistische pleiotropie, met name de tegenstrijdige effecten op Alzheimer-risico bij vrouwen en kankerrisico bij mannen, verklaren waarom genen die late-onset Alzheimer veroorzaken, in de populatie blijven bestaan.
Dit artikel betwist de bevindingen van Shenhar et al. dat de erfelijkheid van de menselijke levensduur na verwijdering van 'extrinsieke' sterfte tot 55% stijgt, omdat de aanname dat sterfte door infecties en ongevallen genetisch onafhankelijk is biologisch onhoudbaar is en leidt tot een vertekende, overmatige schatting van de erfelijkheid.
Dit onderzoek toont aan dat residu-plasma van routinematige klinisch-chemische tests, mits snel verwerkt en gekoeld, een waardevolle en onderbenutte bron vormt voor cfDNA-biobanken en moleculaire testen met vergelijkbare kwaliteit als gespecialiseerde buizen.
Deze studie onthult dat cognitieve veerkracht bij de ziekte van Alzheimer niet het ontbreken van pathologie is, maar een actief genregulerend mechanisme waarbij BCL6-gemedieerde onderdrukking van NF-κB in glia-cellen, in tegenstelling tot pathologische FLI1/IKZF1-activering, de cognitieve achteruitgang voorkomt ondanks zware neuropathologie.
Deze studie toont aan dat de gedeelde genetische factoren tussen astma en longfunctie afhankelijk zijn van de leeftijd bij astma-aanvang, waarbij de effecten op de longfunctie bij vroeg opkomend astma sterker worden gedreven door deze genetische associaties, met name via genen op chromosoom 5.
Deze studie toont aan dat de implementatie van een gemainstreamd zorgmodel voor pediatric inborn errors of immunity (IEI) in Queensland, Australië, leidde tot significante verbeteringen in genomische testpraktijken, waaronder een hogere diagnostische opbrengst, minder dubbele testen en een afname van varianten met onzekere betekenis.
Een post-hoc analyse van de ASPREE-trial toont aan dat een triglyceride-gerelateerd polygenisch score het effect van aspirine op bloedingen en cardiovasculaire risico's bij ouderen significant beïnvloedt, waarbij aspirine schadelijk is voor personen met een lage score maar gunstig voor personen met een hoge score.
Deze studie introduceert EGRET, een ensemble-framework dat cis- en trans-eQTLs combineert om genexpressie beter te voorspellen, waardoor de detectie van ziekte-gerelateerde genen en het in kaart brengen van genregulatienetwerken aanzienlijk verbetert ten opzichte van bestaande methoden.
Deze paper introduceert PheMED, een statistische methode en software die GWAS-samenvattingen gebruikt om effectgroottevervaging door fenotype-fouten te detecteren en te corrigeren, waardoor de nauwkeurigheid van replicatie- en heritabiliteitsanalyses wordt verbeterd.
Een landelijke enquête onder Franse ouders toont aan dat de acceptatie van uitgebreide en genomische pasgeborenescreening hoog is, maar wordt beïnvloed door de verwachte gezondheidsvoordelen, de emotionele houding en de tolerantie voor onzekerheid, waarbij vertrouwen en sociale afstand de steun moduleren.
Deze studie presenteert een geïntegreerd deep learning-framework dat data-augmentatie en uitlegbare grafische neurale netwerken combineert om de classificatie van RNA-Seq-gegevens voor ziektediagnose, zoals nierkanker, te verbeteren en biologisch interpreteerbare resultaten te leveren ondanks beperkte steekproefgroottes.
Deze genomische associatiestudie identificeerde specifieke genetische varianten die onafhankelijk van de COPD-diagnose bijdragen aan variatie in extrapulmonaire kenmerken zoals functionele capaciteit, spierkracht en ziektebelasting, wat de biologische basis voor de heterogeniteit van de ziekte verduidelijkt.
Dit artikel beschrijft de opzet van het AMBER-onderzoek binnen de Generation Scotland-cohort, waarbij via een vragenlijst aan 1.180 deelnemers met een antidepressivagebruiksgeschiedenis gedetailleerde data zijn verzameld om biologische mechanismen achter de variatie in antidepressiva-respons te onderzoeken en toekomstige proefpersonen te selecteren voor verdere biologische analyses.
Dit onderzoek gebruikt verzadigingsgenoomediting om bijna alle BARD1-varianten te testen, waardoor 95,4% van de onzekere genetische varianten kan worden opgelost en het verband tussen BARD1-functieverlies en een verhoogd risico op borstkanker wordt bevestigd.